Protein–RNA interactions for Protein: B1B1D3

Zfp40, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp40B1B1D3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms