Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ssxb8B1AY40 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ssxb8B1AY40 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ssxb8B1AY40 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ssxb8B1AY40 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ssxb8B1AY40 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ssxb8B1AY40 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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