Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
1700042G07RikB1AUF7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
1700042G07RikB1AUF7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms