Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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