Protein–RNA interactions for Protein: A6X935

Itih4, Inter alpha-trypsin inhibitor, heavy chain 4, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itih4A6X935 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itih4A6X935 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itih4A6X935 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itih4A6X935 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Itih4A6X935 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itih4A6X935 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itih4A6X935 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itih4A6X935 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itih4A6X935 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itih4A6X935 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms