Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms