Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll11A4Q9F4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms