Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms