Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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