Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ism1A2ATD1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ism1A2ATD1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms