Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms