Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms