Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms