Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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