Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms