Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms