Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WNZ6

1700025B11Rik, RIKEN cDNA 1700025B11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025B11RikA0A087WNZ6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
1700025B11RikA0A087WNZ6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700025B11RikA0A087WNZ6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms