Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5538W4VSP6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms