Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt27Q9Z320 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms