Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Homer1Q9Z2Y3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms