Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Crlf3Q9Z2L7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Crlf3Q9Z2L7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Crlf3Q9Z2L7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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