Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms