Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tulp1Q9Z273 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms