Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip6Q9Z1Y4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms