Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NgfrQ9Z0W1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms