Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Cldn3Q9Z0G9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Cldn3Q9Z0G9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Cldn3Q9Z0G9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Cldn3Q9Z0G9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Cldn3Q9Z0G9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Cldn3Q9Z0G9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Cldn3Q9Z0G9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Cldn3Q9Z0G9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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