Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms