Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkraQ9WTX2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms