Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms