Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms