Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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