Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Col4a4Q9QZR9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Col4a4Q9QZR9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Col4a4Q9QZR9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Col4a4Q9QZR9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Col4a4Q9QZR9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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