Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms