Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms