Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer2Q9QWW1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms