Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln8Q9QUK3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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