Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Reep6Q9JM62 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms