Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms