Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gde1Q9JL56 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gde1Q9JL56 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gde1Q9JL56 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gde1Q9JL56 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gde1Q9JL56 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gde1Q9JL56 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gde1Q9JL56 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gde1Q9JL56 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gde1Q9JL56 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms