Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms