Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms