Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms