Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga3Q9JJZ8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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