Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Smpd3Q9JJY3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Smpd3Q9JJY3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Smpd3Q9JJY3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Smpd3Q9JJY3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
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Smpd3Q9JJY3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
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Smpd3Q9JJY3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Smpd3Q9JJY3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Smpd3Q9JJY3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Smpd3Q9JJY3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Smpd3Q9JJY3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Smpd3Q9JJY3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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