Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms