Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhojQ9ER71 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms