Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQS9

Igdcc4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igdcc4Q9EQS9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igdcc4Q9EQS9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igdcc4Q9EQS9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Igdcc4Q9EQS9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igdcc4Q9EQS9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igdcc4Q9EQS9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igdcc4Q9EQS9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igdcc4Q9EQS9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igdcc4Q9EQS9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Igdcc4Q9EQS9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igdcc4Q9EQS9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igdcc4Q9EQS9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igdcc4Q9EQS9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Igdcc4Q9EQS9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Igdcc4Q9EQS9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Igdcc4Q9EQS9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Igdcc4Q9EQS9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igdcc4Q9EQS9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms