Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms