Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop7Q9DCH2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms