Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms